📄 文献精读 · 机制与过程调控

单细胞蛋白生产的途径与机制:富集紫色非硫细菌的碳氮磷转化与污泥发酵液资源回收 | 彭博士工具屋

以红外光富集、以 Rhodopseudomonas palustris 为主的紫色非硫细菌处理污泥发酵液(FL)。乙酸为唯一碳源时碳去除 53.4%、生物量产率 0.85 gCOD/gCOD、蛋白占菌体 58%;以 FL 为基质时 TOC 去除 53.4%、生物量产率 0.89 gCOD/gCOD、蛋白占 65%,每克生物质可得 0.65 g 单细胞蛋白。PHB 累积受外源碳源可得性而非营养盐水平调控。

PNSB单细胞蛋白PHB多聚磷酸盐污泥发酵液碳氮磷转化
💡 核心结论:红外富集的 R. palustris 主导菌群可在光照厌氧下同步同化碳、氮、磷并生产蛋白:乙酸基质下蛋白占菌体 58%、生物量产率 0.85 gCOD/gCOD;以污泥发酵液为基质时 TOC 去除 53.4%、蛋白占菌体 65%、产率 0.89 gCOD/gCOD。
📑 目录

文献信息

英文题名
Pathways and Mechanisms of Single-Cell Protein Production: Carbon and Nutrient Transformation
作者
Dan Wu, Liang Zhang, Chencheng Le, Li Wang, Yan Zhou
期刊 / 年份
ACS ES&T Water 2021
DOI
10.1021/acsestwater.1c00084
卷期 / 页码
1(5): 1313–1320
单位
新加坡南洋理工大学南洋环境与水研究所先进环境生物技术中心及土木与环境工程学院
一句话概括:以污泥发酵液(FL)为碳氮源、红外光富集 PNSB,通过四批循环试验解析碳、氮、磷的胞内外转化路径,并结合 DAPI/Nile red 双染色与 LC-MS/MS 氨基酸分析,评估单细胞蛋白与营养回收效率。

一图不看也要知道的几件事

  • 红外光下 R. palustris 相对丰度从种子菌的 53% 升至 93%,暗条件下仅为 60%。
  • 乙酸为唯一碳源时:乙酸约 120 h 耗尽,生物量由 0.94±0.06 增至 1.41±0.01 gVSS/L,生物量产率 0.85 gCODbiomass/gCODremoved。
  • PHB 在 120 h 峰值达 0.56 mg/mg 生物量,约为既往报道的 4.3 倍;磷在 72–96 h 释放 109±6 mg/L、在 PHB 峰值时回吸 90±1 mg/L。
  • 蛋白由 TN 估算约占菌体 58%(乙酸基质);15 种氨基酸被检出,丙氨酸最高约 0.344±0.001 g/g 生物量,为文献值的 7.8 倍。
  • 类胡萝卜素在光照 120 h 达 8.82 mg/g 生物质(DCW),暗条件全程维持低位。
  • 以 FL 为基质:7 天内去除 53.4% TOC,其中 72% 由乙酸与戊酸贡献;NH₄⁺-N 转化 43.4%、PO₄³⁻-P 转化 36%。
  • FL 试验中生物量由 0.72±0.01 增至 1.14±0.21 gVSS/L,产率 0.89 gCODbiomass/gCODremoved;蛋白约占菌体 65%,每克生物质得 0.65 g 单细胞蛋白。
  • FL 试验中 PHB 累积 0.24–0.3 mg/mg,以天冬氨酸为主要氨基酸(约 0.224±0.007 g/g 生物量),总氨基酸升至 0.87 g/g 生物量。
  • FL 特性:TOC 2.43 g/L、铵 479.01±69.79 mg/L、磷酸盐 465.61±5.17 mg/L、乙酸 17.85±0.63 mM、戊酸 1.65±0.25 mM,溶解性总 COD 约 5340 mg/L(其中 30.7% 为 VFA)。

研究背景与要解决的问题

PPB(紫色光养细菌)可从废水中回收碳、氮、磷,以光和“免费”光能为能源;既有研究显示在最优 COD:N:P 下总 COD、氮、磷去除率可达 97%、92%、94%,回收营养可转化为蛋白并用作鱼饲料。

与异养微生物的碳矿化不同,PPB 通过碳同化去除有机物,在简单底物上生物量产率可达 1.0 gCOD/gCODremoved;磷可通过无机多聚磷酸盐形式去除,氮固定于菌体并生成有价值的氨基酸,此外还检出 PHA。

PPB 代谢可能同时涉及碳、氮、磷与光四种关键生物转化,但是否同时发生、如何安排转化优先级尚不清楚,尤其碳、氮、磷代谢途径之间的相互作用被长期忽视。

传统污泥处理用厌氧消化将有机物转为沼气再发电/热,但能量转化效率较低(47.01 J·gCOD⁻¹·d⁻¹);通过热水解等使污泥溶出 VFA 后的发酵液富含碳、磷与铵,适合作 PNSB 的碳氮源。

概念与技术边界

PNSB / PPB
紫色非硫细菌(紫色光养细菌),可在光照厌氧下同化有机物并回收氮磷,是废水处理与单细胞蛋白生产的候选菌群。
PHB
聚-β-羟基丁酸,一种胞内碳与能量储存聚合物;本研究中乙酸为唯一碳源时只检出 PHB。
poly-P(多聚磷酸盐)
胞内磷的储存与能量缓冲形式,其水解可提供 ATP,与 PHB 的消耗/累积相对应。
Feast-famine 与碳源可得性调控
通常认为营养限制促进 PHA 累积,但本研究发现 PHB 主要受外源碳源(乙酸)可得性调控,而非氮磷水平。
污泥发酵液(FL)
污泥经嗜热碱性(55 ℃、pH 9.9)发酵产生 VFA 的液体,含较高铵与磷酸盐,可作 PNSB 的碳氮源。

体系与方法

环节做法与参数
接种与富集从回收污泥发酵液资源的微生物燃料电池(MFC)出水中富集 PNSB;血清瓶装 150 mL 新鲜培养基(乙酸钠 1.0 g/L、KH₂PO₄ 4.4 g/L、K₂HPO₄ 3.4 g/L、NH₄Cl 1.3 g/L 等),充氩 5 min 密封,红外光源(仅透 >680 nm)室温培养;OD660 由 0.2 升至 0.6 用 6 天,第 10 天扫描 450–1100 nm 确认富集。
批次转化试验6 个血清瓶各装 140 mL 新鲜培养基与 10 mL 富集菌,5 mM PBS 维持中性 pH;三瓶铝箔遮光作暗对照、三瓶红外光照,150 rpm 连续振荡每日取样;试验重复四批分别测液相碳氮磷(I)、胞内 PHA/碳水/TN/TP(II)、氨基酸与类胡萝卜素(III)、顶空气体 CO2/H2/O2/CH4/N2(IV)。
污泥发酵与进料混合初沉/二沉污泥(1:1 w/w)在 7 L 发酵罐(工作体积 3 L)55 ℃、pH 9.9 发酵产 VFA;进 PNSB 前将 FL 稀释 10 倍、12000 g 离心 10 min 去固形物,以 1 M HCl 调 pH 至 7.0±0.2,运行 7 天每日取样。
分析方法COD 试剂盒(Hach 8000/DR800 HR);NH₄⁺-N、NO₃⁻-N、NO₂⁻-N、PO₄³⁻-P 标准方法;TN/TOC 燃烧-红外(Shimadzu TOC-5000A);VFA 用 GC/FID(DB-FFAP 柱);顶空气体用 GC/TCD(Agilent 7890A)。
胞内组分测定DAPI 与 Nile red 顺序双染色,Nikon A1R 共聚焦显微镜结合 NIS Elements 4.10 分析定位 poly-P 与 PHA;PHB/PHV/PH2MV 用 GC 定量;生物量经 6 M HCl 110 ℃ 24 h 消解测胞内总磷;碳水化合物用 HPLC(BC-Hi-Plex H 柱);类胡萝卜素超声辅助提取后 480 nm 定量;氨基酸经 6 M HCl 水解后用 LC-MS/MS(正离子模式,m/z 50–500)鉴定。
菌群分析取 MFC 出水在光照与暗条件终点样品提取 DNA,用 341F/806R 引物扩增 16S rRNA V3-V4 区高通量测序,97% 相似度聚类为 OTU。

主要结果(原文图表逐条解读)

图形摘要(第 1 页):富集 PNSB 对碳、氮、磷的摄取与转化示意。
图形摘要(第 1 页):富集 PNSB 对碳、氮、磷的摄取与转化示意。
图示信息:左侧为受光照的血清瓶,向瓶内输入乙酸钠(C)、铵(N)与磷酸二氢钾(P);右侧为菌体内部放大示意,C、N、P 进入细胞后经电子传递与 ATP 生成,转化为生物质(单细胞蛋白)、poly-P(来自磷摄取)以及糖原与 PHB(胞内碳/能量储存)。
论文结果:示意图概括本研究提出的转化框架:PNSB 利用光能与简单 C/N/P 底物合成富含蛋白的生物质,同时以 poly-P 形式储磷、以 PHB 与糖原形式储存碳与能量。
研究意义:该框架是全文的机制主线:碳、氮、磷三条转化并非各自独立,而是共同服务于生物质(蛋白)合成,并在外源碳受限时由胞内储存物接续供能。
Figure 1(第 3 页):物种水平细菌分布。展示 MFC 出水、光照与暗条件三类样品的前 25 个类群。
Figure 1(第 3 页):物种水平细菌分布。展示 MFC 出水、光照与暗条件三类样品的前 25 个类群。
图示信息:热图形式,列为 MFC 出水、Light、Dark,行为各 OTU/物种并按门分类(Proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteria、Bacteroidetes),色阶表示相对丰度。
论文结果:光照条件下 R. palustris 相对丰度从种子菌的 53% 升至 93%;暗条件下仅 60%。暗条件下还出现 Rhodocyclaceae(2%)等电活性菌,以及与复杂有机物降解相关的 Pseudomonas caeni(2%)、Escherichia coli(1%)、Lactobacillus pentosus(1%)。
研究意义:光源是维持 R. palustris 高丰度的关键,也说明可从生物电化学系统中富集 PNSB;暗条件下群落向化能异养与电活性菌偏移。
Figure 2(第 4 页):光照条件下 (A) 乙酸、NH₄⁺-N、PO₄³⁻-P 与生物量(以 COD 计)的循环变化;(B) 胞内磷、碳水化合物与 PHB 的循环变化。
Figure 2(第 4 页):光照条件下 (A) 乙酸、NH₄⁺-N、PO₄³⁻-P 与生物量(以 COD 计)的循环变化;(B) 胞内磷、碳水化合物与 PHB 的循环变化。
图示信息:双联时间序列图,横轴为时间(约 0–170 h),纵轴为浓度;按 PHB 谱将反应周期分为 I(0–72 h)、II(72–120 h)、III(120 h 后)三阶段。
论文结果:乙酸自起始迅速下降并在约 120 h 基本耗尽,同时伴随 NH₄⁺-N 与 PO₄³⁻-P 消耗;生物量由 0.94±0.06 升至 1.41±0.01 gVSS/L,产率 0.85 gCODbiomass/gCODremoved,终点仍有 34.7 mg TOC/L 残留(LC-OCD 检出小分子有机酸,非 VFA)。阶段 I(0–72 h)储存 PHB 被快速降解,25% 的磷被去除并转化为 poly-P,同时生成 5.34 mg 碳水/g 生物量;此阶段摄取 0.43 g 乙酸/L(相当于 0.466 g COD/L)、生物量增长约 0.342 gVSS/L(0.48 g COD/L),乙酸几乎全部转化为活性生物质(产率 1.03 gCOD/gCOD乙酸)。阶段 II(72–120 h)乙酸与 NH₄⁺-N 继续被摄取而磷被释放,PHB 迅速累积至 120 h 的 0.56 mg/mg 生物量,期间 72–96 h 释放 109±6 mg P/L、在 PHB 最高时回吸 90±1 mg/L。阶段 III 外源碳耗尽后 NH₄⁺-N 消耗与生物量增长仍继续,累积的 PHB 被快速消耗、磷再现释放-摄取周转;氢仅在 120 h 后被检出。
研究意义:碳、氮、磷的转化并不同步,而是由外源碳源可得性而非营养盐水平决定;PHB 既是碳源也是能量源,poly-P 水解与光合磷酸化共同供能。氢仅在无外源碳、PHA 无法累积后出现,说明还原力需另寻排出途径。
Figure 3(第 4 页):PNSB 共聚焦荧光显微图:(A) Nile red 荧光;(B) DAPI 荧光;(C) Nile red 与 DAPI 合并图。
Figure 3(第 4 页):PNSB 共聚焦荧光显微图:(A) Nile red 荧光;(B) DAPI 荧光;(C) Nile red 与 DAPI 合并图。
图示信息:三张同视野荧光照片,A 为 Nile red 通道(红色,标记 PHA),B 为 DAPI 通道(蓝色,标记 poly-P),C 为二者叠加。
论文结果:PHB 与 poly-P 颗粒被检出位于同一批细胞内,重叠信号表明两类储存物共定位于细胞中。
研究意义:为胞内 PHB 与 poly-P 的同步储存提供直接形态学证据,印证富集 PNSB 在严格厌氧与红外光照下可同时捕获 COD、氮与磷。
Figure 4(第 5 页):光合作用产物谱:(A) 必需氨基酸组成;(B) 生物质中蛋白(以 TN 估算);(C) 一个周期内总氨基酸;(D) 类胡萝卜素。
Figure 4(第 5 页):光合作用产物谱:(A) 必需氨基酸组成;(B) 生物质中蛋白(以 TN 估算);(C) 一个周期内总氨基酸;(D) 类胡萝卜素。
图示信息:四联图:A 为 15 种氨基酸在不同时间点(初始、24、48、72、96、120、144 h)的含量柱状图;B 为蛋白随时间的折线;C 为总氨基酸随时间的变化;D 为光照与暗条件下类胡萝卜素含量对比。
论文结果:共检出 15 种氨基酸(组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、丙氨酸、天冬氨酸、缬氨酸等),丙氨酸为主要氨基酸(约 0.344±0.001 g/g 生物量,为既往报道的 7.8 倍),天冬氨酸、谷氨酸与脯氨酸也较高;总氨基酸随时间逐渐升高。由 TN 估算的蛋白含量约 58%,即周期末活性生物质的大部分细胞重量为蛋白。光照下类胡萝卜素在 120 h 快速累积至 8.82 mg/g 生物质(DCW),此后因外源碳受限而基本稳定;暗条件下全程偏低,残余量可能来自前次富集培养的携带。文献报道 PPB 类胡萝卜素为 0.5–13 mg/g 生物质、均值 <4.0 mg/g。
研究意义:氮被同化进胞内蛋白,氨基酸随铵消耗与 TN 累积同步上升;类胡萝卜素生成在乙酸耗尽的 120 h 停止,说明储存的 PHB 并不支持类胡萝卜素生成,光合磷酸化可能也在 120 h 后停止。作者提示氨基酸实测值可能高于真实值。
Figure 5(第 6 页):以 FL 为基质、光照条件下 (A) TOC、乙酸与戊酸的变化;(B) NH₄⁺-N、PO₄³⁻-P 与生物量(以 COD 计)的变化。
Figure 5(第 6 页):以 FL 为基质、光照条件下 (A) TOC、乙酸与戊酸的变化;(B) NH₄⁺-N、PO₄³⁻-P 与生物量(以 COD 计)的变化。
图示信息:双联 7 天时间序列图,A 左轴为 TOC 与乙酸浓度(mg/g VSS)、右轴为戊酸(mg/g VSS);B 左轴为 NH₄⁺-N(mg/g VSS)、右轴为 PO₄³⁻-P(mg/g VSS)与生物量(gVSS/L)。
论文结果:乙酸自周期开始被快速优先利用,约 5 天基本耗尽;乙酸耗尽后自第 5 天起消耗 13.43 mg 戊酸/g VSS。7 天内去除 53.4% TOC,其中 72% 由乙酸与戊酸贡献,其他低分子量中性化合物也被逐步转化或消耗。碳去除伴随 NH₄⁺-N 与 PO₄³⁻-P 消耗,43.4% NH₄⁺-N 与 36% PO₄³⁻-P 被转化(期间亦观察到释放)。生物量由 0.72±0.01 增至 1.14±0.21 gVSS/L,产率 0.89 gCODbiomass/gCODremoved。
研究意义:证实发酵液可替代纯乙酸作为 PNSB 的碳氮源,碳、氮、磷的同步转化在复杂基质下依然成立,且出现与纯乙酸试验相似的释放-摄取周转。
Figure 6(第 6 页):(A) 生物质中总蛋白(以 TN 估算)与 PHB 的变化;(B) 来自 FL 的总氨基酸。
Figure 6(第 6 页):(A) 生物质中总蛋白(以 TN 估算)与 PHB 的变化;(B) 来自 FL 的总氨基酸。
图示信息:双联柱状图,横轴为 0、1、2、3、4、5、7 天;A 为总蛋白与胞内 PHB(mg/g 生物量),B 为总氨基酸(mg/g 生物量)。
论文结果:以 FL 为基质时 PHB 累积约 0.24–0.3 mg/mg 生物量且未检出其他类型 PHA,PHB 经历快速消耗与再生成、磷出现释放-摄取周转。蛋白随时间逐渐升高并在第 7 天达约 0.65(图中量级),由 TN 估算的蛋白约占生物质 65%(正文写作约 65%),总氨基酸升至 0.87 g/g 生物量。FL 基质下的主要氨基酸为天冬氨酸(约 0.224±0.007 g/g 生物量),胱氨酸、丝氨酸与亮氨酸含量较高。
研究意义:以 FL 为基质产出的蛋白与最优条件下纯乙酸基质相当,说明 PNSB 用发酵液生产蛋白可行;氨基酸组成随基质不同而变化,反映不同碳源会诱导不同代谢途径与产物,具体机制仍需进一步研究。
Table 1(第 2 页,原表未提取为图片,仅文字解读):发酵液(FL)特性。
图示信息:列出 FL 的 pH、TOC、铵、磷酸盐、乙酸与戊酸等参数及单位。
论文结果:pH 7.0±0.2;TOC 2.43±8.77 g/L;铵 479.01±69.79 mg/L;磷酸盐 465.61±5.17 mg/L;乙酸 17.85±0.63 mM;戊酸 1.65±0.25 mM。正文补充:溶解性总 COD 约 5340 mg/L,其中 30.7% 为 VFA,发酵罐性能与 FL 特性在运行期内相对稳定。
研究意义:FL 兼具碳源(VFA)与营养盐(铵、磷酸盐),且特性稳定,是其可替代合成培养基作为 PNSB 底物的前提。

机制小结

  • 碳、氮、磷转化不同步,由外源碳源可得性而非营养盐水平决定:乙酸充足时碳优先流向活性生物质合成(阶段 I 产率 1.03 gCOD/gCOD乙酸),碳源受限时转向储存聚合物的消耗与再累积。
  • PHB 兼具碳源与能量源功能:外源碳耗尽后 PHB 被快速消耗以支撑生物量增长与氮同化,其累积则受乙酸可得性调控,而非氮磷是否充足。
  • 磷经历多轮摄取与释放,且胞内 TP 与液相 PO₄³⁻-P 对应;poly-P 水解与光合磷酸化共同供能,PHB 与 poly-P 颗粒共定位于同一细胞。
  • 无外源碳时还原力需另寻出路:氢仅在 120 h 后(外源碳耗尽、PHA 无法累积时)被检出,说明 PNSB 需替代途径排出生物量增长产生的还原力。
  • 氮以胞内 TN 形式逐步累积并转化为蛋白与氨基酸,液相无亚硝酸盐与硝酸盐检出,溶解态氮几乎全部转化为胞内 TN。
  • 暗条件下代谢显著放缓,但胞内 PHB 与 poly-P 仍出现周转,PNSB 转向化能营养以维持厌氧暗环境下的生存。

工程与产业含义

  • 污泥发酵液可经稀释 10 倍、离心去固形物并调 pH 至中性后直接作为 PNSB 底物,7 天即可获得 0.65 g 单细胞蛋白/g 生物质,为污泥资源高值化提供路线。
  • 相比厌氧消化产沼气(能量转化效率约 47.01 J·gCOD⁻¹·d⁻¹),将污泥转化为单细胞蛋白更有利于减少资源损失。
  • 过程可利用红外光选择性富集光养菌(光源仅透 >680 nm 以抑制产氧光养菌),并以非无菌的富集混合菌群运行。
  • 系统可同步实现 COD/TOC 与氮磷去除,减少后续处理负担;生物质同时含蛋白、类胡萝卜素与 PHB,具备多产品回收潜力。

适用与不适用场景

✅ 适用场景
  • 以 VFA(乙酸、戊酸等)为主的污泥发酵液或类似高浓度有机废水的处理与蛋白回收
  • 具备光照条件的 PNSB 资源化系统(红外光富集光养菌)
  • 希望将污泥从产沼气转向高值蛋白/生物聚合物的场景
  • 需要同步去除碳与氮磷并回收单细胞蛋白的养殖饲料原料生产
⚠️ 不适用 / 需谨慎
  • 无光照条件下的处理:暗条件下碳与营养转化显著降低
  • 未稀释、含高固形物的原始发酵液直接进料
  • 以产甲烷/产氢为主要目标的能量回收场景

局限与不确定性

作者未解决 / 需要读者注意的问题
  • 暗条件下 R. palustris 丰度在阶段 III 末仅 33%,所得性能不能完全归因于 R. palustris,故未进一步讨论其底物转化与途径。
  • 作者指出测得的氨基酸浓度可能高于真实值,导致生物质总氨基酸含量偏高。
  • 氨基酸与产物组成受基质影响显著,不同碳源诱导不同代谢途径的机制尚待研究。
  • FL 试验仅运行 7 天,未验证长期连续运行的稳定性与规模化表现。

数据 · 代码 · 经费 · 利益冲突

支持信息(PDF)随文提供,含富集期 PNSB 性能、暗条件下胞内外化合物的循环变化以及以发酵液为进料时溶解性有机物与氨基酸组成变化的鉴定。资金来自南洋理工大学先进环境生物技术中心(AEBC)、新加坡博士研究基金与南洋理工大学跨学科研究生院;作者声明无竞争性财务利益。

来源与链接

🐾 返回主站