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光合细菌污水氮转化制蛋白:氮源浓度与类型如何影响产量 | 彭博士工具屋

以合成糖废水为底物、光照厌氧条件(2000 lux,26–30 ℃,C/N=15,3 d)培养光合细菌(PSB),比较不同氮源浓度与类型对产蛋白的影响。NH4-N 200 mg/L 时蛋白含量最高(48.52%),产率 58.01 mg/(L·d);单一氮源中尿素最好(转化率 3.35、蛋白 565.4 mg/L);NH4-N+NO3-N 组合产率最高,达 130.35 mg/(L·d),氮转化率 3.3。氮平衡显示被利用氮中 68.4% 来自 NH4-N、31.6% 来自 NO3-N,pro-N 增至 12.46 mg。

光合细菌污水资源化氮代谢单细胞蛋白转录组氮平衡
💡 核心结论:在 200 mg/L 氮浓度、NH4-N+NO3-N 组合供给条件下,PSB 的氮转化率达 3.3、蛋白产率峰值 130.35 mg/(L·d),被利用氮中 68.4% 来自 NH4-N、31.6% 来自 NO3-N,pro-N 提升至 12.46 mg。
📑 目录

文献信息

英文题名
Insights into Wastewater Nitrogen Conversion to Protein via Photosynthetic Bacteria
作者
Wei Zhao, Chenghao Wu, Sijia Zheng, Guangming Zhang
期刊 / 年份
Water 2025
DOI
10.3390/w17060826
卷期 / 页码
17(6), 826
单位
黑龙江大学黑龙江河湖管理研究院;重庆市大足区发展和改革委员会;河北工业大学能源与环境工程学院
一句话概括:用合成糖废水在不同氮源浓度与类型下培养光合细菌混合菌,结合氮元素平衡与 Rp. palustris 转录组,定位控制氮向蛋白转化的关键酶基因,指出 NH4-N+NO3-N 组合与 Nas/GDH/GltS 缺失是产量差异的机制来源。

一图不看也要知道的几件事

  • 实验采用合成糖废水,PSB 接种量 20%(v/v),光照厌氧(氩气顶空、2000 lux 白炽灯),26–30 ℃,C/N=15,周期 3 d。
  • NH4-N 去除率在 93.56%–96.89% 间,各浓度均较高。
  • NH4-N 浓度 200 mg/L 时产蛋白最佳:蛋白含量 48.52%,蛋白产率 58.01 mg/(L·d);超过 200 mg/L 后产量随氨氮升高而下降。
  • 单一氮源中尿素最优:氮转化率 3.35、蛋白浓度 565.4 mg/L。
  • 单一 NH4-N 条件下蛋白产率 611 ± 13 mg/g,氮转化率 3.71。
  • NO2-N、NO3-N 作单一氮源均不利,两者氮转化率均低于 1.0(浓度 200 mg/L)。
  • 组合氮源氮转化率约 3.3(NH4-N+NO2-N 组为 2.15);NH4-N+NO3-N 组蛋白产率最高 130.35 mg/(L·d)。
  • 氮平衡实验初始总氮 71.07 mg;NH4-N 占比由 47% 降至 5%,NO3-N 由 38% 降至 17%;生成 25.76 mg bio-N,其中 pro-N 12.46 mg。
  • 气态氮占 27%,有机氮占比提升 15%,NO2-N 仅 0.03 mg;被消耗氮源 68.4% 来自 NH4-N、31.6% 来自 NO3-N。
  • Rp. palustris 转录组中 nirK(4607)、norB(1479)、nosZ(4877)转录本计数高,指示显著反硝化;glnA 1744、gltB 12158 与谷氨酸形成相关;该条件下蛋白产量 437.4 mg/g。
  • Rp. palustris 因缺少硝酸还原酶、GLDH、GDH 与 GltS,蛋白产率仅 53.28 mg/(L·d)。

研究背景与要解决的问题

全球蛋白资源短缺背景下,微生物蛋白(单细胞蛋白,SCP)因蛋白、维生素、必需氨基酸与脂质含量高而受关注;光合细菌(PSB)蛋白含量一般高于 40%,可用作饲料、肥料,甚至食品或食品添加剂。

PSB 已能从啤酒废水、家禽场/屠宰场/糖厂废水等多种废水中产蛋白;但氮转化对蛋白产量的影响研究较少,已有工作基本聚焦氨氮,且多停留在实验与模型参数优化层面。

氮是蛋白的重要组成,PSB 可将底物中的氮转化为生物量中的有机氮。不同氮源如何影响氮转化与蛋白合成,其底层机制仍不清楚。

本研究系统考察氮源浓度与类型对 PSB 产蛋白的影响,并通过氮平衡与氮代谢分析揭示转化机制,确定有利于产蛋白的氮源条件。

概念与技术边界

PSB(光合细菌)
能在光照下利用有机物或 CO2 生长的细菌类群,蛋白含量高,是污水资源化与单细胞蛋白生产的候选微生物。
SCP(单细胞蛋白)
即微生物蛋白,由微生物细胞体提供的蛋白来源,可作饲料或食品补充。
氮转化率
文中定义为蛋白转化浓度与氮源消耗浓度之比,衡量氮被转为蛋白的效率(如 3.35、3.3)。
pro-N
蛋白氮,等于生物量中蛋白浓度除以氮-蛋白换算系数 6(本文取值)。
bio-N
细胞中的氮,用元素分析仪测定。
非-pro-N
bio-N 中除 pro-N 之外的氮,可能以其他含氮化合物形式存在于 PSB 生物量中。
Nas / GDH / GltS / GLDH
分别指同化型硝酸还原酶、谷氨酸脱氢酶、谷氨酸合酶、谷氨酸脱氢酶类,氨/硝酸盐同化生成谷氨酸的关键酶;其缺失会限制氮的高效利用,进而限制蛋白产量。
pro-N 与氮-蛋白换算系数 6
文中的换算方式:蛋白氮 = 蛋白浓度 / 6。

体系与方法

环节做法与参数
废水与菌种采用合成糖废水(参考文献所述配方);PSB 为以 Rp. palustris 为优势菌的混合菌,另用来自苏州的纯 Rp. palustris 做氮代谢实验。接种前培养至生物量 2000 mg/L,改良 RCVBN 培养基、120 r/min、26–30 ℃、2000 lux 培养。
反应器与运行300 mL 锥形瓶装 240 mL 废水,接种 20%(v/v);光照厌氧(顶空氩气冲洗 5 min 后橡胶塞密封),2000 lux 白炽灯,26–30 ℃,C/N=15,周期 3 d。
氮源浓度实验以 NH4-N 为氮源,设 50、200、500、1000、3000、5000 mg/L 共 6 组。
氮源类型实验(NH4)2SO4、NaNO2、NaNO3、尿素分别代表 NH4-N、NO2-N、NO3-N、有机氮;设置 NH4-N、NO2-N、NO3-N、NH4-N+NO2-N、NH4-N+NO3-N、尿素、NH4-N+尿素 7 组。
氮平衡实验选取上述确定的最佳浓度与类型条件,测定进水中氮、接种液中 bio-N、无机氮与有机氮;总初始氮 71.07 mg;因光照厌氧条件,气态氮由初始总氮与末期其他形态氮的差值按元素平衡计算。
氮代谢实验条件与氮平衡相同,仅菌种改为 Rp. palustris;另设不接种 PSB 的无菌阴性对照,未观察到显著的非生物氮转化影响。
分析测定11,000 rpm 离心 10 min 取上清测 TN、NH4-N、NO2-N、NO3-N(APHA 法),有机氮为 TN 减去三者;660 nm 测生物量;蛋白用改良 Lowry 法试剂盒;bio-N 用元素分析仪;pro-N=蛋白浓度/6。
分子分析TRIzol 提 RNA,NEB Next Ultra 建库,Illumina HiSeq 测序;FastQC 质检、Trimmomatic 修剪,HISAT2(v2.2.1) 比对,FeatureCounts 定量,DESeq2(v3.20) 差异表达(FDR<0.05),KEGG 注释与通路富集,构建氮代谢通路图。

主要结果(原文图表逐条解读)

Fig. 1 不同氮源浓度下的蛋白产量(原文 Figure 1. Protein production under different nitrogen source concentrations)
Fig. 1 不同氮源浓度下的蛋白产量(原文 Figure 1. Protein production under different nitrogen source concentrations)
图示信息:组合图:横轴为氮源浓度 50、200、500、1000、3000、5000 mg/L;左轴(0–500 mg/L)为蛋白浓度柱,右轴(约 32%–56%)为蛋白含量折线;内嵌小图给出各浓度下 NH4-N 去除率。
论文结果:蛋白浓度在 200 mg/L 处最高(约 415 mg/L),随后随浓度升高而下降;蛋白含量由 50 mg/L 时约 46% 微升至 200 mg/L 时约 48%,之后持续下降到 5000 mg/L 时约 37%;NH4-N 去除率在各浓度下均维持约 93%–97%。原文给出 200 mg/L 时蛋白含量 48.52%、产率 58.01 mg/(L·d),NH4-N 去除率范围 93.56%–96.89%。
研究意义:存在明确的氨氮浓度阈值(200 mg/L),过高浓度对微生物产生毒性、抑制产蛋白;过低则氮源不足。该结果直接支撑后续氮平衡与转录组实验选择 200 mg/L 作为操作点。
Fig. 2 不同氮源类型下的蛋白产量(原文 Figure 2. Protein production under different nitrogen source types)
Fig. 2 不同氮源类型下的蛋白产量(原文 Figure 2. Protein production under different nitrogen source types)
图示信息:堆叠柱状图:横轴为 NH4-N、NO2-N、NO3-N、NH4-N+NO2-N、NH4-N+NO3-N、尿素、NH4-N+尿素 7 组;每根柱下方(橙红色)为蛋白(mg/L)、上方(浅蓝)为生物量(mg/L);黑色方点虚线给出蛋白含量(%)。
论文结果:NH4-N+NO3-N 组总生物量最大(约 1060 mg/L)、蛋白最高(约 850 mg/L);单一 NO3-N 组蛋白最低(约 175 mg/L);蛋白含量约 57%–64%,NO2-N、NO3-N、NH4-N+NO3-N 组偏低,NH4-N+尿素组最高。原文给出:尿素单一氮源氮转化率 3.35、蛋白 565.4 mg/L;NH4-N 单一氮源蛋白 611 ± 13 mg/g、氮转化率 3.71;NO2-N 与 NO3-N 转化率均低于 1.0;组合氮源转化率约 3.3(NH4-N+NO2-N 为 2.15);NH4-N+NO3-N 蛋白产率 130.35 mg/(L·d)。
研究意义:单一氮源中尿素/氨氮优于亚硝酸盐与硝酸盐;组合氮源普遍优于单一氮源,且不同组合机制不同——NH4-N+NO3-N 可能直接促进蛋白转化通路,NH4-N+尿素可能通过提高生物量间接提高总蛋白。
Fig. 3 实验起始与结束时的氮组成(原文 Figure 3. The nitrogen composition at the start and the end of the experiment)
Fig. 3 实验起始与结束时的氮组成(原文 Figure 3. The nitrogen composition at the start and the end of the experiment)
图示信息:两根 100% 堆叠柱(0 d 与 3 d,总氮 71.07 mg),并用斜线连接对应氮形态,展示各形态占比变化。
论文结果:NH4-N 由 47% 降至 5%,NO3-N 由 38% 降至 17%;生成气态氮占比 27%、有机氮占比提升 15%;pro-N 提升 14%、非-pro-N 占 7%;NO2-N 仅 0.03 mg;被消耗氮源中 68.4% 来自 NH4-N、31.6% 来自 NO3-N。
研究意义:气态氮的出现证明 PSB 混合菌存在反硝化途径,可将 NO3-N 转为 N2;但微生物仍主要依赖 NH4-N 转化产蛋白,后续优化应聚焦如何促进 NH4-N 向蛋白的转化。
Fig. 4 该实验条件下的氮代谢网络(原文 Figure 4. The nitrogen metabolism network based on this experimental condition)
Fig. 4 该实验条件下的氮代谢网络(原文 Figure 4. The nitrogen metabolism network based on this experimental condition)
图示信息:氮转化通路图:蓝色为反硝化(胞外硝酸盐经 nrtA/B/C 转运,nasS → 亚硝酸盐,nirK → NO,norB → N2O,nosZ → N2);绿色为同化型硝酸盐还原(nirA);橙色为固氮(nifD);紫色为铵同化(glnA → 谷氨酰胺,gltB → 谷氨酸);虚线为其他反应(ncd2/npdA、nitrilase、formamidase、cynS、碳酸酐酶等)。
论文结果:该条件下的关键酶基因使用情况与常规反硝化(narBGHI、nirBDKS、nrfAH、napAB)不同,使用的是同化型硝酸还原酶基因 nasS;谷氨酸脱氢酶通路相关关键酶基因未被检出,只剩谷氨酰胺途径可走;这与 53.28 mg/(L·d) 的较低蛋白产率相符。
研究意义:硝酸还原酶整体活性偏低、关键酶基因适配性不佳,可能解释 NH4-N+NO3-N 条件下硝酸盐转化较低;同时存在其他可能影响产蛋白的氮代谢支路(硝基烷烃、氰酸盐、腈类转化为氨等),提示处理含此类化合物废水时适度浓度或可促进产蛋白。
Table 1 样品(SPL)与 Rp. palustris TIE-1(REF)在氮代谢中的转录本计数比较(原表无法提取为图片,仅文字解读)
图示信息:两列对比 SPL 与 REF 的基因转录本计数,并列出对应酶名。
论文结果:多数基因 SPL 与 REF 计数一致:nrtA 13/13、nrtB 3/3、nrtC 14/14、nasS 46/46、npdA 580/580、nirK 4607/4607、norB 1479/1479、nosZ 4877/4877、nifD 25/25、nirA 15/15、cynS 22/22、glnA 1744/1744、gltB 12158/12158;另列出碳酸酐酶 393、甲酰胺酶 42、腈水解酶 25、ncd2 677。大计数转录本的 nirK、norB、nosZ 证明反硝化显著;glnA 与 gltB 的显著计数可解释该条件下 437.4 mg/g 的蛋白产量。
研究意义:转录本水平表明实验条件下 Rp. palustris 的氮代谢基因表达与已知全基因组菌株 TIE-1 总体一致,为通路推断提供了基因层面的对照基准。

机制小结

  • 同化作用:PSB 通过氮转运(amtB、nrtABC)、铵同化(glnA、gltB、gltD)与硝酸盐还原(nasA、narB)相关基因上调,将氮源转化为生物量中的有机氮与蛋白。
  • 反硝化:nirK、norB、nosZ 高表达证明存在显著反硝化,NO3-N 可被还原为 N2 而损失,也可经同化还原为 NH4-N 再进入生物量。
  • 氨同化路径缺失:谷氨酸脱氢酶(GLDH/GDH)与谷氨酸合酶(GltS)相关关键酶基因未检出,只剩氨→谷氨酰胺→谷氨酸途径,限制氨向谷氨酸的高效转化。
  • 氮源偏好:被利用氮中 68.4% 来自 NH4-N,说明在氨氮与硝酸盐共存时 PSB 优先利用氨氮。
  • 高浓度亚硝酸盐可通过提高氧化胁迫、破坏细胞膜、降低光合作用抑制 PSB 生长与产蛋白。

工程与产业含义

  • 氮源选型:若以产蛋白为目标,优先考虑 NH4-N 与 NO3-N 组合(产率 130.35 mg/(L·d)),单一氮源中尿素最优。
  • 浓度控制:氨氮控制在约 200 mg/L 附近,超过该值产蛋白下降,高浓度(如 1000 mg/L)对微生物有明确抑制。
  • 氮损失核算:氮平衡中 27% 转化为气态氮,意味着系统存在不可忽视的氮损失,实际工程需权衡脱氮与蛋白回收。
  • 优化方向:应聚焦促进 NH4-N 向蛋白的转化而非单纯脱氮;对含硝基烷烃、氰酸盐、腈类等化合物的废水,适度浓度可能不仅无毒性还可促进产蛋白。
  • 菌种差异:不同 Rp. palustris 菌株在关键酶基因上的有无会直接决定产蛋白能力,选育时应关注 Nas、GDH、GltS 等酶的存在情况。

适用与不适用场景

✅ 适用场景
  • 以氨氮和硝酸盐共存为主的合成糖废水或类似高氮工业/市政废水的 PSB 产蛋白工艺设计
  • 选择 PSB 处理氮源的浓度阈值与氮源类型组合时的参数参考
  • 利用转录组与氮平衡识别氮代谢瓶颈(如氨同化路径缺失)的菌种筛选与改造研究
⚠️ 不适用 / 需谨慎
  • 以实际复杂废水为对象时需重新验证,本研究使用合成糖废水
  • 仅 3 d 实验周期,不能直接外推到长期连续运行的稳定性
  • 高浓度氨氮(>1000 mg/L)体系,本研究表明该条件对微生物有毒性

局限与不确定性

作者未解决 / 需要读者注意的问题
  • 实验为 300 mL 锥形瓶批次试验、周期 3 d,与连续流放大运行存在差距。
  • 氮平衡中气态氮由差值法计算,且光照厌氧条件,未直接测定气体组成。
  • 转录组仅取单一条件、单一菌株(Rp. palustris)样本,未做多条件比较或时间序列。
  • 蛋白采用 Lowry 法并除以系数 6 换算 pro-N,换算系数的普适性未在本文验证。
  • 阴性对照仅说明未观察到显著非生物氮转化,未给出定量数据。
  • 文中未给出各氮源类型组生物量的具体数值。

数据 · 代码 · 经费 · 利益冲突

数据可用性:研究产生和分析的数据集可向通讯作者索取(available from the corresponding author on request)。经费:国家水体污染控制与治理科技重大专项 2018ZX07110003、黑龙江省自然科学基金 LH2022C098、城市水资源与水环境国家重点实验室 2022 年开放基金 ES202217、黑龙江省省属高校基本科研业务费 2023-KYYWF-1495。利益冲突:作者声明无利益冲突。

来源与链接

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